该所建于1955年。初为安徽省农业试验总站病虫防治组;1960年建院后为安徽省农业科学院植物保护研究室;1975年11月，由安徽省农林科学院农业研究所植物保护研究室和微生物研究所的生物防治研究室合并成立安徽省农林科学院植物保护研究所;1978年恢复安徽省农业科学院后，改为现名。下设科研部、新农药开发部、综合技术开发部、推广经营部，还设有办公室和农药中试厂。拥有试验田1.3公顷，科研及农药中试工厂生产用房共2 000多平方米，以及常规化验、测试分析仪器及农药中试厂设备。

该所有职工46人，其中科技干部34人，高级研究人员16人，中级研究人员12人。主要任务是，开展水稻、小麦、油菜 ......