福建主要药用菌有灵芝、茯苓、猪苓、猴头、虫草、天麻蜜环菌等。灵芝对血液和神经系统有良好保健作用。以灵芝精粉配制成的保健药有胶囊、冲剂、口服液、饮料等。茯苓是中药处方中常用药物，具有安神、滋补、利尿、消肿、养肺等功效。茯苓药材是重要的出口物资，主要销往港澳、日本、新加坡、泰国、印度等地。虫草菌株省内已有5个在生产上应用，菌丝干粉已批量出口。猴头菇已可大规模栽培，子实体切片和浸出液制成的药物，可用以防治消化系统疾病和癌症。许多食用菌本身也同时有药用功效，如银耳有清热润肺功效，香菇有提高免疫功能和防癌功效 ......
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