1986年9月，按照国家科委、财政部《关于做好地方科研事业费划转工作的通知》，福建科研事业费划转改革全面展开。至1987年2月，省级科研事业费划转工作完成， 省属农业科研事业费划归省科委统一管理。1987年7月地(市)级划转工作全部完成， 1988年上半年县级划转工作也基本完成。

1987年3月6日， 省科委、省财政厅联合下达《关于印发技术开发研究单位改革减拨事业费的意见通知》，并对省级59个科研单位进行分类。绝大多数农业科研单位划归包干类型，仅有省农机研究所、省水轮泵研究所、省亚热带园艺植物研究中心等划归技术开发类型。

同时，省科委、省财政厅制定《关于实行包干制单位科研 ......