将有害的家畜废弃物转化为无害，保留原有营养成分，以使其被有效利用的措施。家畜废弃物中大量的是家畜的粪便，也包括死亡家畜的尸体。这类病死家畜尸体，一般采取焚烧或高压热处理。大型畜牧场每天生产的废弃物数量很大，是一项对环境重要的污染源。粪便处理方法要依据粪便含水量而定。当粪便中含固形物少于15%时，通常作液体粪便处理;当含有固形物超过20%时，通常作固态粪便处理。粪便经处理或加工后，可作为有机肥料，产生沼气或作为家畜和水生生物的再生饲料。经过处理后的粪便、污染水，应符合国家规定的排放标准。
固态粪便用作农田肥料： 新鲜的粪便不宜直接施入农田， ......
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