厅机关下设11个处室： 办公室、人事处、政策体改法规处、科技教育与质量标准处、计划财务处、市场信息处、经济作物处、粮油生产处、机关党委、纪检组 (监察室)、审计处。

厅属正处级单位23个： 省植保植检站、土肥站、农技推广总站、农机鉴定站、兽医总站、种子管理站(种子公司)、省棉花科研所、蚕桑科研所、水产科研所、畜牧兽医科研所、微生物科研所、厅对外经济技术合作中心、《湖南农业》 杂志社、长沙农校、安江农校、农机化学校、厅后勤服务中心、厅离退休人员服务所、省贺家山原种场、湖南生物药厂、省农机总公司、农垦公司、水产公司。

厅属副处级单位4个： 省优质农产品 ......