吉林省兽类资源也很丰富。据不完全统计，计有80种，隶属于7目21科。是长白山野生动物中仅次于鸟类的第二大类群，其中不少种类还是国家重要的珍稀动物。

食虫目。该目一般个体较小，吻部尖细，是比较原始的兽类。在长白山生活有3科10种，其中，刺猬科2种： 普通刺猬和短刺猬; 鼹科1种： 缺齿鼹; 鼩鼱科7种： 大鼩鼱、普通鼩鼱、中鼩鼱、栗齿鼩鼱、水鼩鼱，北小麝鼩、大麝鼩。

翼手目。该目是比较古老而又十分特化的小型兽类，能借助于前肢特化成的翼膜飞翔，是兽类中唯一能够真正飞翔的动物。所以过去有人将它归入鸟类。该目动物在长白山生活有2科10种。其中菊头蝠科1种： 大菊头蝠; 蝙 ......