畜禽良种繁育体系建设经历了以下三个主要历史阶段：

1. 恢复阶段(1949—1960年)。新中国成立后，随着农牧业的恢复发展和农业合作化的实现，畜禽良种繁育体系的建设开始成为畜牧业发展的组成部分，家畜繁育机构开始组建，猪、马、牛、羊的良种引进，杂交改良，家畜人工配种等技术开始运用并逐步推广。但由于受生产力水平和物质基础条件的限制，这一阶段良种繁育体系的发展比较缓慢，良种繁育技术处于恢复发展状态。

2. 徘徊发展阶段(1960—1978年)。3年自然灾害和“文化大革命”对畜牧业产生严重影响，良种繁育体系建设和规划时断时续。60年代初期，山东省农业厅投资设立了黄牛、德州驴 ......