中国的综合性水利科学研究机构(简称南科院)， 设在江苏省南京市。 承担水利、 水运、 水电工程和其他有关工程中的一些关键性的试验研究任务， 并从事一部分理论研究工作。 它的前身为“中央水工试验所”， 创建于1935年， 1942年改为“中央水利实验处”，1949年定名为南京水利实验处。1956年改名为水利部南京水利科学研究所。 1957年将原交通部水运科学研究院的港工与航道研究所并入南科所， 改由水利部、 交通部共同领导。 1984年1月改名“南京水利科学研究院。

南科院设有水工研究所、 河港研究所、 土工研究所、 材料结构研究所、 技术情报研究室等。 现有职工800余人， 其中高级工程师30 ......